菲律宾在古代是称作吕宋，自宋元时期以来，菲律宾就开始和中国有贸易的往来，在明朝时正式称菲律宾为吕宋。
在唐朝时期中国就就开始和菲律宾各地有贸易往来，在菲律宾当地，考古发掘甚至发现有日期在3世纪的中国留下的遗迹。
在明朝时期，吕宋有大吕宋和小吕宋之分，是因为在1571年到1898年，菲律宾被西班牙侵占，所以在《海录》里译作小吕宋，而以大吕宋称呼西班牙。在西班牙统治菲律宾时，将西班牙称为大吕宋，菲律宾称为小吕宋。
菲律宾在很早以前是以吕宋、麻逸、苏禄、胡洛等地的名称闻名的。公元三世纪左右，同中国友好往来。14世纪前后，菲律宾出现了由土著部落和马来族移民构成的一些割据王国，其中最著名的是14世纪70年代兴起的海上强国苏禄王国。
麦哲伦在环球航行中首次发现了菲律宾群岛，并参与了当地的内乱，在械斗中身不幸重伤亡。1565年西班牙殖民者攻占菲律宾群岛，以西班牙皇太子菲律普命名该地，故称菲律宾，
在1898年美西战争爆发，6月12日菲律宾宣告独立，成立菲律宾共和国。随后西班牙战败，签署“巴黎和约”，美国接收菲律宾，改由美国统治。(为美属菲律宾领地)。1935年3月24日，菲律宾建立菲律宾自治邦，二战期间为日本所据(1942年-1945年)，日本占领菲律宾后建立傀儡政权(菲律宾第二共和国)。
1942年，菲律宾被日本占领。第二次世界大战结束后，菲律宾再次沦为美国殖民地。1946年7月4日，美国被迫同意菲律宾独立。此后，自由党和国民党轮流执政。到了1946年7月4日，菲律宾才获得完全独立。
1965年马科斯就任二战后第六任总统，并三次连任。1971年，斐迪南·马科斯成功连任，同年取消总统任期只有两届的限制，未久即宣布戒严，开始独裁统治。
1983年8月，反对党领导人贝尼格诺·阿基诺被谋杀，导致政局动荡。1986年2月7日，提前举行总统选举，贝尼格诺·阿基诺的夫人科拉松·阿基诺在民众、天主教会和军队的支持下出任总统。此后，拉莫斯和埃斯特拉达先后按宪制当选总统。
古籍记载菲律宾古称记述
《明史·外国传四·吕宋》：“吕宋居南海中，去漳州甚近。洪武五年正月遣使偕琐里诸国来贡。”
《清史稿·属国传三·苏禄》：“西班牙既据吕宋，欲以苏禄为属国，苏禄不从，西人以兵攻之，为所败。”
清·胡燏棻《上变法自强条陈疏》：“以低潮十成之银，易库纹十成之价，如墨西哥、吕宋、日本等国之洋钱是也。”
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